Los hábitats de las tierras bajas del Pacífico en el Istmo de Tehuantepec y de la Planicie Costera de Chiapas han sido significativamente modificados durante el último siglo, debido primeramente al cambio en el uso de suelo. Anteriormente ampliamente cubiertas por arbustos áridos tropicales y Selvas bajas caducifolias, siendo la vegetación original casi completamente remplazada por campos de cultivo y pastoreo. Dentro de esta provincia, en la zona sur del Istmo de Tehuantepec gran parte de la vegetación corresponde al Bosque Espinoso, con una serie un tanto heterogénea de comunidades vegetales que tienen en común la característica de ser bosques bajos y cuyos componentes, al menos en gran proporción, son árboles y arbustos espinosos.

En las zonas más cercanas a la costa (sur de la región) la vegetación se vuelve más árida, hasta el punto de ser considerada en algunas partes como Matorral Xerófilo. En las orillas sureñas de la Laguna Superior e Inferior se pueden encontrar Dunas, así como pequeños manchones de Manglar distribuidos en las orillas de los sistemas. lagunares. Debido a la deforestación la vegetación de Galería es ya muy restringida en la región, aunque se pueden encontrar pequeños ejemplos de este tipo de vegetación en algunos tramos de los ríos existentes y en algunas ocasiones a lo largo de algunos de los arroyos permanente y temporales.